RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 MYOTQ9UBF9 498 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 MLXQ9UH92 298 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TEX46H3BTG2 121 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 HFEQ30201 348 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ZAR1Q86SH2 424 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 OTULINQ96BN8 352 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 LRRC46Q96FV0 321 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ARHGDIGQ99819 225 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.24□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 CDC14CA4D256 554 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 UTS2O95399 124 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SERPINA7P05543 415 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 OSMP13725 252 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 HPGDP15428 266 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TBXA2RP21731 343 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 GIFP27352 417 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ABCD3P28288 659 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ADH7P40394 386 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 GAS1P54826 345 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 MAPK14Q16539 360 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 HACD4Q5VWC8 232 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SHFQ7M4L6 423 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 OR1S1Q8NH92 325 aa9.23□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.23□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 BIN3Q9NQY0 253 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 IL17BQ9UHF5 180 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NINQ8N4C6 2090 aa9.23□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TMEM129A0AVI4 362 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SCDO00767 359 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 HPXP02790 462 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ALDOBP05062 364 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 FABP1P07148 127 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NPIPA8P0DM63 369 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SMIM11AP58511 58 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 FOXC1Q12948 553 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 CHAF1BQ13112 559 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 IL10RAQ13651 578 aa9.22□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 KLHL26Q53HC5 615 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.22□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.22□□□□□ -0.93
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GINS3-201ENST00000318129 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 CDHR4A6H8M9 788 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SERINC4A6NH21 518 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 L7N2F9 121 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 SOX14O95416 240 aa9.22□□□□□ -0.93
GINS3-201ENST00000318129 ADAP00813 363 aa9.22□□□□□ -0.93
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