RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFB6O95139 128 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TGM6O95932 706 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF20P17024 532 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 RAB6AP20340 208 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 AKT2P31751 481 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 EFNB2P52799 333 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TAS2R19P59542 299 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FAM3CQ92520 227 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 C2orf72A6NCS6 295 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GPR89BP0CG08 455 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 THBS2P35442 1172 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GAS1P54826 345 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF273Q14593 569 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 OR52W1Q6IF63 320 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 HAVCR1Q96D42 359 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CMBLQ96DG6 245 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC3BQ96PB8 259 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 OPN4Q9UHM6 478 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 EMC9Q9Y3B6 208 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PSME4Q14997 1843 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CTSVO60911 334 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 LILRB5O75023 590 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ITGA5P08648 1049 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A9P48067 706 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF136P52737 540 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A24Q6NUK1 477 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 BVESQ8NE79 360 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 NANPQ8TBE9 248 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FGF13Q92913 245 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 MARC2Q969Z3 335 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PRR13Q9NZ81 148 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS38A1L453 326 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PMP2P02689 132 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 H2BFMP0C1H6 154 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CTRB1P17538 263 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PRPS1P60891 318 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 UBA52P62987 128 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ESX1Q8N693 406 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PGLYRP3Q96LB9 341 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FLRT3Q9NZU0 649 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PCDHB10Q9UN67 800 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GLCEO94923 617 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC2A1P11166 492 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CCL5P13501 91 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 RUNX3Q13761 415 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TOMM20Q15388 145 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 CORO6Q6QEF8 472 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 SLC41A2Q96JW4 573 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TAS2R4Q9NYW5 299 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0A6YYH2 397 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 GGT3PA6NGU5 568 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 A6NJ64 397 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 H3BML4 177 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 TACR3P29371 465 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 BTG2P78543 158 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2G7Q13093 441 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRN-201ENST00000295718 BAMBIQ13145 260 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms