RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc38a7	Q8BWH0	463 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpat3	Q8C0N2	438 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4930451G09Rik	Q8C5G4	195 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sphk1	Q8CI15	382 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clip4	Q8CI96	704 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mcfd2	Q8K5B2	145 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rorb	Q8R1B8	470 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxw7	Q8VBV4	629 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpe	Q8VEE0	228 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1079	Q8VF52	315 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1309	Q8VF83	320 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddit4l	Q8VHZ5	193 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Oosp1	Q925U0	202 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atoh8	Q99NA2	322 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abcg3	Q99P81	650 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpa3	Q9CQ71	121 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem9	Q9CR23	183 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf181	Q9CY62	165 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem50b	Q9D1X9	158 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mmab	Q9D273	237 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Duoxa2	Q9D311	320 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc3	Q9D6Y1	273 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9D979	236 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ssmem1	Q9D9Y8	244 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dda1	Q9D9Z5	102 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Alg5	Q9DB25	324 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tprg1l	Q9DBS2	266 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Syt13	Q9EQT6	426 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rcl1	Q9JJT0	373 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kifc1	Q9QWT9	674 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Poll	Q9QXE2	573 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col13a1	Q9R1N9	751 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sh3bgr	Q9WUZ7	214 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bcl3	Q9Z2F6	448 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clec4d	Q9Z2H6	219 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arfgef2	A2A5R2	1792 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kiaa1107	Q80TK0	1369 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv1-31	A0A0A6YWK5	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm45618	A0A1B0GSA0	219 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shisal2a	A2A9G7	189 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1189	A2AV11	306 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prrg1	A2BFE8	218 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lipo2	D3YY49	398 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adamtsl5	D3Z689	485 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp983	E9PUT0	460 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	C2cd2	E9Q3C1	696 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r75	G5E8Z7	853 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r52	L7N2B2	852 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r77	L7N2B7	854 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr329-ps	M9MMK4	331 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pias3	O54714	628 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cask	O70589	926 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01729	129 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01739	132 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxb7	P09024	217 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd3g	P11942	182 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Svs4	P18419	113 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fcgr1	P26151	404 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccnb2	P30276	398 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	P2ry2	P35383	373 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nkx1-2	P42580	305 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sumo2	P61957	95 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ctps2	P70303	586 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pkp1	P97350	728 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptpn2	Q06180	406 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp781	Q0P5U5	243 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex30	Q3TUU5	225 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm648	Q3UJ22	213 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam220a	Q3ZN08	260 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ift52	Q62559	426 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cpeb3	Q7TN99	716 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1212	Q7TR08	311 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd9	Q8BH83	326 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc24	Q8BHA1	521 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Faap24	Q8BHL6	221 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BHR8	331 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Synb	Q8BI41	618 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ficd	Q8BIX9	458 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Itih5	Q8BJD1	952 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc5a8	Q8BYF6	611 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Castor2	Q8CAB8	329 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nup58	Q8R332	587 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr665	Q8VG79	316 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1413	Q8VGU3	323 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubl7	Q91W67	380 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Glyat	Q91XE0	296 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tf	Q921I1	697 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psph	Q99LS3	225 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fars2	Q99M01	451 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Flywch2	Q9CQE9	139 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ly6k	Q9CWP4	154 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iqcf5	Q9DAL7	148 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9DAQ5	155 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nmnat1	Q9EPA7	285 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slco1a1	Q9QXZ6	670 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spry4	Q9WTP2	300 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Loxl3	Q9Z175	754 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex11a	Q9Z211	246 aa		3.63	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prob1	A0A087WR45	1010 aa		3.62	□□□□□ -1.83
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Btbd18	A0A0A6YY25	723 aa		3.62	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.9 ms