RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rplp0P14869 317 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gstm2P15626 218 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aqp8P56404 261 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P58686 83 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ca10P61215 328 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxc4Q08624 264 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cass4Q08EC4 804 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxw16Q497Z0 464 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prm3Q62100 101 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tdpoz5Q6YCH1 340 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl20Q80ZM3 255 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Coro2bQ8BH44 480 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apbb3Q8R1C9 486 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr578Q8VH17 313 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alg2Q9DBE8 415 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcne3Q9WTW2 103 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eci2Q9WUR2 391 aa15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem44E9Q4M0 433 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01851 173 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01852 173 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TsxP70675 144 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs16P97428 201 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nxpe2Q3U095 558 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxj3Q8BUR3 623 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrebzfQ91ZR3 358 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp12Q9D0T2 339 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dapl1Q9D757 107 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9D8N1 392 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SmpxQ9DC77 85 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phf1Q9Z1B8 559 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xlr4aA2BI40 215 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r101E9PZS9 857 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21820J3KMU2 361 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xlr4cQ3TKR2 215 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mier2Q3U3N0 541 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankub1Q3UUE9 192 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc38a8Q5HZH7 432 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tssk1bQ61241 365 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr429Q7TRW1 312 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl13Q80TF4 654 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Otop1Q80VM9 600 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddhd2Q80Y98 699 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc38a1Q8K2P7 485 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Duoxa1Q8VE49 341 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xlr4bQ9JJQ7 215 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam18Q9R157 719 aa15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Skint8A7XV07 398 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam71f1Q3UZD7 341 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt6Q8CE96 497 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp28Q8CGV8 520 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B3galnt1Q920V1 331 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arv1Q9D0U9 266 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Get4Q9D1H7 327 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shisa5Q9D7I0 235 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lime1Q9EQR5 269 aa15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr115B2RTB9 312 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wscd2D4PHA7 571 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CcnkO88874 554 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps4xP62702 263 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufb6Q3UIU2 128 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm136Q3V037 328 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif1aQ60872 144 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zrsr1Q64707 428 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SynprQ8BGN8 265 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrfn5Q8BXA0 719 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stbd1Q8C7E7 338 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhno1Q8K3A4 235 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aqp3Q8R2N1 292 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r42Q8VBS7 329 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr165Q8VFA2 313 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdca4Q9CWM2 237 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actr6Q9D864 396 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ethe1Q9DCM0 254 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Qtrt1Q9JMA2 403 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ate1Q9Z2A5 516 aa15.58■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msl3l2G3X992 371 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oosp3G5E8D7 195 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21797J3QNW5 180 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3542K7N6U2 270 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8050L7N2E3 205 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FxnO35943 207 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifi204P0DOV2 619 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MagP20917 626 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HexaP29416 528 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FaslgP41047 279 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snai2P97469 269 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp25Q3U435 615 aa15.57■□□□□ 0.08
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1031Q7TR87 336 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms