RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM107BQ9H098 131 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 MED31Q9Y3C7 131 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1W2PRG6 482 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 B9A039 149 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP8B1O43520 1251 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF682O95780 498 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 F13BP05160 661 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 THRBP10828 461 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC7A2P52569 658 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 HGFACQ04756 655 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ADIPOQQ15848 244 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM168AQ92567 244 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 FKBP7Q9Y680 259 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 ALPK2Q86TB3 2170 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 LY6HO94772 140 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB36O95755 333 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 THBS4P35443 961 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT2P50583 147 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 CLRN1P58418 232 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP37Q8NFH4 326 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 C20orf141Q9NUB4 165 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 B3GNT2Q9NY97 397 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-215ENST00000621029 FN1P02751 2386 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 CXCR6O00574 342 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE5AO76074 875 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 F12P00748 615 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHG1P01857 330 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NPR2P20594 1047 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 AQP2P41181 271 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 YAP1P46937 504 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB1AP62820 205 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ST3GAL3Q11203 375 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 DAG1Q14118 895 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT80Q6KB66 452 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF627Q7L945 461 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10H5Q8NGA6 315 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 MS4A3Q96HJ5 214 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NOX3Q9HBY0 568 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 INIPQ9NRY2 104 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ENTPD5O75356 428 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 UBL3O95164 117 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNW1P05000 195 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 GIPRP48546 466 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SEC24CP53992 1094 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 CARTPTQ16568 116 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 VTCN1Q7Z7D3 282 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 TREML1Q86YW5 311 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PRRC1Q96M27 445 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NME4O00746 187 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 DHHO43323 396 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 QDPRP09417 244 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PGA4P0DJD7 388 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PGA3P0DJD8 388 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 DAP3P51398 398 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 KRTAP1-1Q07627 177 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 LRFN4Q6PJG9 635 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 FKBP9P1Q75LS8 142 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC22A24Q8N4F4 322 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SYT14Q8NB59 555 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 CMTM5Q96DZ9 223 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SORCS2Q96PQ0 1159 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 FNDC11Q9BVV2 318 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF442Q9H7R0 627 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 RHCGQ9UBD6 479 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SPEF1Q9Y4P9 236 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 hCG_2039718K7EN88 272 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PIP5K1CO60331 668 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 FARS2O95363 451 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 CSF3P09919 207 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PATE4P0C8F1 98 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8G3PP0DMU2 310 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 IFI30P13284 250 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 MYBPC1Q00872 1141 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 EFNB3Q15768 340 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 HDDC2Q7Z4H3 204 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SKA3Q8IX90 412 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SVOPLQ8N434 492 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 MOSPD2Q8NHP6 518 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 PLK3Q9H4B4 646 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 YAE1D1Q9NRH1 226 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 A4GNTQ9UNA3 340 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SH3PXD2BA1X283 911 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 NDUFAB1O14561 156 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 IGF2P01344 180 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A16P16260 332 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 LSP1P33241 339 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 GSK3BP49841 420 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF84P51523 738 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 LAPTM4AQ15012 233 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-215ENST00000621029 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms