RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN1O95832 211 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DGKZQ13574 1117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EXT1Q16394 746 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR12P47775 334 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1CAP62136 330 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NFATC4Q14934 902 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 MDGA2Q7Z553 956 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PRU2 124 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ETV3P41162 512 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 CLDN10P78369 228 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PGGHGQ32M88 737 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TP53I3Q53FA7 332 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMUB2Q71RG4 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM4P0C7M7 580 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T7P0C7T2 308 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NXPE3Q969Y0 559 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR5B2Q96R09 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 GABRR3A8MPY1 467 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 RAF1P04049 648 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FCGR2AP12318 317 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FCER1GP30273 86 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPLD1P80108 840 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 CSF2RAP15509 400 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 ST8SIA4Q92187 359 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO24O75426 580 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CBX7O95931 251 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 EVX2Q03828 476 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EID2BQ96D98 161 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LILRB3O75022 631 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SPINT3P49223 89 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR10A3P58181 314 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRT-209ENST00000612229 RTL10Q7L3V2 364 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 F5H5K5 113 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 AOAHP28039 575 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HBA1P69905 142 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB134Q4QY38 66 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.48□□□□□ -1.37
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