RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 OR6X1Q8NH79 312 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 RFKQ969G6 155 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM45BQ96B21 275 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 Q96MT0 163 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIB1Q96RU8 372 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ALG12Q9BV10 488 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 BCO1Q9HAY6 547 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 DOCK7Q96N67 2140 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ATMQ13315 3056 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IRGMA1A4Y4 181 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SH3D21A4FU49 640 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF716A6NP11 495 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 H0YC42 278 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MS4A18H0YCH9 400 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SURF4O15260 269 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC43A1O75387 559 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SERPINI2O75830 405 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 YES1P07947 543 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IFNGR1P15260 489 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MYF6P23409 242 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CRABP1P29762 137 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TIMP3P35625 211 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ACVR1BP36896 505 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 BLVRAP53004 296 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A1P53007 311 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CLDN17P56750 224 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CLRN1P58418 232 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ERVK-25P63136 954 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IL5RAQ01344 420 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TMED1Q13445 227 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 STK11Q15831 433 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 C3AR1Q16581 482 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 C6orf52Q5T4I8 152 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF691Q5VV52 312 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MTFR2Q6P444 385 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 USP51Q70EK9 711 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 AAED1Q7RTV5 226 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC103Q8IW40 242 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 OR2T4Q8NH00 348 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF519Q8TB69 540 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM163Q8TC26 289 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ABHD3Q8WU67 409 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ASB10Q8WXI3 467 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF566Q969W8 418 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms