RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577241.1

MSI2-205, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-205	ENST00000577241	CBR1	P16152	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ARR3	P36575	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CLRN1	P58418	232 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FOXB1	Q99853	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	VLDLR	P98155	873 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MELK	Q14680	651 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DHH	O43323	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	STAMBP	O95630	424 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FABP3	P05413	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	BMP4	P12644	408 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ACADS	P16219	412 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MAK	P20794	623 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CAPZA2	P47755	286 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF84	P51523	738 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ADAM8	P78325	824 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ROS1	P08922	2347 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A6NIZ1	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241		E7EQL1	145 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	OVOL3	O00110	214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	UBL3	O95164	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	GADD45G	O95257	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	IGHM	P01871	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	SEMG1	P04279	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	QDPR	P09417	244 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	CD99	P14209	185 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	TTK	P33981	857 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	PTH2R	P49190	550 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	CTXN1	P60606	82 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	RAP1B	P61224	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	RAP1A	P62834	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	PGGHG	Q32M88	737 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MSI2-205	ENST00000577241	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22

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