RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 OBP2BQ9NPH6 170 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 DNAJB9Q9UBS3 223 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ITPR2Q14571 2701 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 PAX7P23759 505 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ERFP50548 548 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 NR1H2P55055 460 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.93■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 WNT11O96014 354 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 HRGP04196 525 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ACVR1BP36896 505 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 OR52N5Q8NH56 324 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 FANK1Q8TC84 345 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 FNDC8Q8TC99 324 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ALG12Q9BV10 488 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 SLC25A15Q9Y619 301 aa22.92■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 APCP25054 2843 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ERVK-25P63136 954 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 HIST3H3Q16695 136 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 GPR139Q6DWJ6 353 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 PIK3IP1Q96FE7 263 aa22.91■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 ENTPD5O75356 428 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 E2F6O75461 281 aa22.9■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF627Q7L945 461 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 WDR31Q8NA23 367 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 SYT14Q8NB59 555 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF519Q8TB69 540 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 GIPC3Q8TF64 312 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 KCNK17Q96T54 332 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 CACNA1DQ01668 2161 aa22.9■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.89■■□□□ 1.25
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NME3-209ENST00000566600 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.89■■□□□ 1.25
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NME3-209ENST00000566600 GASTP01350 101 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 GSTM3P21266 225 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 SLC6A6P31641 620 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 RPS6KA3P51812 740 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 ARHGDIAP52565 204 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 MCHR2Q969V1 340 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 PLPPR2Q96GM1 343 aa22.89■■□□□ 1.25
NME3-209ENST00000566600 ZNF570Q96NI8 536 aa22.89■■□□□ 1.25
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