RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561637.5

NME3-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-202ENST00000561637 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 RUNX1T1Q06455 604 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 CYBRD1Q53TN4 286 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 SH3GL1Q99961 368 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 RNF13O43567 381 aa21.85■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 ZNF229Q9UJW7 825 aa21.85■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 OR6X1Q8NH79 312 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-202ENST00000561637 TMEM160Q9NX00 188 aa21.84■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 F13BP05160 661 aa21.83■■□□□ 1.09
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NME3-202ENST00000561637 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa21.82■■□□□ 1.08
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NME3-202ENST00000561637 SLC25A16P16260 332 aa21.82■■□□□ 1.08
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NME3-202ENST00000561637 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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NME3-202ENST00000561637 GID8Q9NWU2 228 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-202ENST00000561637 VWC2LB2RUY7 222 aa21.8■■□□□ 1.08
NME3-202ENST00000561637 HIST1H2ABP04908 130 aa21.8■■□□□ 1.08
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