RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	EMC8	O43402	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TBL1X	O60907	577 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SCGN	O76038	276 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TM7SF2	O76062	418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	BRI3	O95415	125 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	F10	P00742	488 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CST4	P01036	141 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	IGLV3-19	P01714	112 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SERPINE2	P07093	398 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CSN3	P07498	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	HLA-E	P13747	358 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CPN1	P15169	458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PAX1	P15863	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CA4	P22748	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	HSD11B1	P28845	292 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CASP14	P31944	242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MATK	P42679	507 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OR3A1	P47881	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GNG10	P50151	68 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TPMT	P51580	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CCL11	P51671	97 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RAP1GDS1	P52306	607 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MTCP1	P56278	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	AP3S2	P59780	193 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CDR2	Q01850	454 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KLC1	Q07866	573 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ILK	Q13418	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CRMP1	Q14194	572 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ITIH4	Q14624	930 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PDK2	Q15119	407 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TSC22D1	Q15714	1073 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC6	Q16204	474 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ACKR1	Q16570	336 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NDUFA5	Q16718	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	BTNL8	Q6UX41	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ASCL4	Q6XD76	172 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CENPU	Q71F23	418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM72B	Q86X60	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF786	Q8N393	782 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC185	Q8N715	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM104	Q8NE00	496 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TCEAL3	Q969E4	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	GLYATL1	Q969I3	302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SMIM10	Q96HG1	83 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	TSSK3	Q96PN8	268 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DYRK4	Q9NR20	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	FGF21	Q9NSA1	209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	DDIT4	Q9NX09	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NDE1	Q9NXR1	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	CD274	Q9NZQ7	290 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
LRRC28-222	ENST00000561431	PHF11	Q9UIL8	331 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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