RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SLC35F4A4IF30 521 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AGAP5A6NIR3 686 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MCIDASD6RGH6 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MRASO14807 208 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 M6PRP20645 277 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NR4A1P22736 598 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GPR4P46093 362 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CDH12P55289 794 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PSME3P61289 254 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ERVK-25P63136 954 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BIKQ13323 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NEDD8Q15843 81 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MFSD4AQ8N468 514 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FADS6Q8N9I5 356 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TMEM234Q8WY98 164 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TSSK2Q96PF2 358 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CD8B2A6NJW9 211 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TO15178 435 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ICMTO60725 284 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLC2A10O95528 541 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 LCKP06239 509 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 IFNGR1P15260 489 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CAPGP40121 348 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLC7A2P52569 658 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CDH11P55287 796 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BIDP55957 195 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 IFITM3Q01628 133 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RUNX1T1Q06455 604 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ATP6AP1Q15904 470 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AVPI1Q5T686 147 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 HCFC1P51610 2035 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GNAO1P09471 354 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 HTR2AP28223 471 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 IFNA8P32881 189 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AQP2P41181 271 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ALDH3B1P43353 468 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NR4A2P43354 598 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 P2RX3P56373 397 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TAS2R41P59536 307 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MAPK11Q15759 364 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CCDC58Q4VC31 144 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 LRP11Q86VZ4 500 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TRIM63Q969Q1 353 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NEURL3Q96EH8 262 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 C12orf10Q9HB07 376 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MRGBPQ9NV56 204 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GVC2 190 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF726A6NNF4 738 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PNMTP11086 282 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AGAP20933 346 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RAC3P60763 192 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.61□□□□□ -1.35
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