RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C12orf42Q96LP6 360 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TGM7Q96PF1 710 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SH3GL3Q99963 347 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 CALYQ9NYX4 217 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 NDUFA13Q9P0J0 144 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEC14L3Q9UDX4 400 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FOXJ3Q9UPW0 622 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 PRR14LQ5THK1 2151 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 TRIM16O95361 564 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 LGALS2P05162 132 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAB21L1Q13394 359 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ARL9Q6T311 187 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PET117Q6UWS5 81 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LHFPL3Q86UP9 236 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 METTL23Q86XA0 190 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 YAE1D1Q9NRH1 226 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HOMER3Q9NSC5 361 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM49BQ9NUQ9 324 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HOXC10Q9NYD6 342 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM153AQ9UHL3 310 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 F10P00742 488 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC30A6Q6NXT4 461 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C16orf87Q6PH81 154 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ASCL5Q7RTU5 278 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 UNC45BQ8IWX7 931 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
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