RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 MBOAT4Q96T53 435 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ACBD6Q9BR61 282 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SLC29A3Q9BZD2 475 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MMP28Q9H239 520 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 C11orf49Q9H6J7 331 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 POPDC2Q9HBU9 364 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 ERVW-1Q9UQF0 538 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 CCDC171Q6TFL3 1326 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 STK36Q9NRP7 1315 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 H7C0C1 242 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 AIM2O14862 343 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZW10O43264 779 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 LALBAP00709 142 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 HLA-DRAP01903 254 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 SYT1P21579 422 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MARK3P27448 753 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GCAP28676 217 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 EVI2BP34910 448 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEA9P43362 315 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 QARSP47897 775 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MFAP2P55001 183 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CDK16Q00536 496 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNB3Q05901 458 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 TIGITQ495A1 244 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 C22orf42Q6IC83 251 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CYS1Q717R9 158 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMUB2Q71RG4 321 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CATSPERDQ86XM0 798 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MTURNQ8N3F0 131 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 C17orf78Q8N4C9 275 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 JAGN1Q8N5M9 183 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM178AQ8NBL3 297 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF680Q8NEM1 530 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR5T3Q8NGG3 340 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR4A4PQ8NGN8 299 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR13C9Q8NGT0 318 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR9A4Q8NGU2 314 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CD300LFQ8TDQ1 290 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SCARB1Q8WTV0 552 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 DNAJA3Q96EY1 480 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF479Q96JC4 524 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ALS2CR12Q96Q35 445 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DGCR6LQ9BY27 220 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR41Q9HAD4 459 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CYP3A43Q9HB55 503 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LY9Q9HBG7 655 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RAB23Q9ULC3 237 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SPEF2Q9C093 1822 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PR80 420 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CCT8L1PA6NM43 557 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 A8MXQ7 604 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TRDCB7Z8K6 153 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 E7EWF7 191 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 HDAC3O15379 428 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GATCO43716 136 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR10H3O60404 316 aa1.84□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 S100A1P23297 94 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TIMP3P35625 211 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CRATP43155 626 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RPS5P46782 204 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DAP3P51398 398 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00205P59089 165 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RAB4BP61018 213 aa1.84□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RPL8P62917 257 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
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