RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PDIK1LQ8N165 341 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIFAP3Q92845 792 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 H3BNH8 94 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 WRBO00258 174 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CSF3P09919 207 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CRISP2P16562 243 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RAB10P61026 200 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF92Q03936 586 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MERTKQ12866 999 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 PSG7Q13046 419 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 IL18Q14116 193 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 BIVMQ86UB2 503 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SGK3Q96BR1 496 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NRTNQ99748 197 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ASB8Q9H765 288 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CDC7O00311 574 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 INSP01308 110 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-34P06331 123 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA5P08758 320 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ELK1P19419 428 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CTRLP40313 264 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA6Q15825 494 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SCD5Q86SK9 330 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR6X1Q8NH79 312 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MYDGFQ969H8 173 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZIM3Q96PE6 472 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 GCNT4Q9P109 453 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 GTF3C1Q12789 2109 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF13O75888 250 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT1P36639 197 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1DP48730 415 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ECH1Q13011 328 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 AQP6Q13520 282 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FZD2Q14332 565 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 RFX4Q33E94 735 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 LCN12Q6JVE5 192 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZSR3 168 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SSX9Q7RTT3 188 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 BBOF1Q8ND07 529 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL13Q8NEE6 735 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 PANX1Q96RD7 426 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 CLMPQ9H6B4 373 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF225Q9UK10 706 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-212ENST00000491302 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 A8MU10 97 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SIRPB1O00241 398 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 XKRYO14609 159 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 OR2F2O95006 317 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA8P13928 327 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A1P43005 524 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 CCR8P51685 355 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf42Q6IC83 251 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-212ENST00000491302 COX15Q7KZN9 410 aa5.27□□□□□ -1.57
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