RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 FAM109AQ8N4B1 249 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 OR2V1Q8NHB1 315 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 DOK1Q99704 481 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF649Q9BS31 505 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 ENPP5Q9UJA9 477 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 RAMP1O60894 148 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 SLC10A1Q14973 349 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 OR52N1Q8NH53 320 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 TM9SF4Q92544 642 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 SLC6A15Q9H2J7 730 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB3-210ENST00000489475 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SCG5P05408 212 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 OR2T7P0C7T2 308 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TGFBR2P37173 567 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CD97P48960 835 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 RGS6P49758 472 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 GALEQ14376 348 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 PDSS1Q5T2R2 415 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SYT14Q8NB59 555 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 OR2T27Q8NH04 317 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 GATAD2BQ8WXI9 593 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 KCNK17Q96T54 332 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ALG8Q9BVK2 526 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SRXN1Q9BYN0 137 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TIGARQ9NQ88 270 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 B9D1Q9UPM9 204 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 H3BMQ9 156 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 AHCYL1O43865 530 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SELENOFO60613 162 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A7O60669 478 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CRABP1P29762 137 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TSTQ16762 297 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF511Q8NB15 262 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 OR10D3Q8NH80 312 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRG7Q96K78 797 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 OPALINQ96PE5 141 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 UCN2Q96RP3 112 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 EMC6Q9BV81 110 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 MFRPQ9BY79 579 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ACKR4Q9NPB9 350 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL13Q9P2N7 655 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ENPP1P22413 925 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 DOC2BQ14184 412 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 LYPD4Q6UWN0 246 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 APC2O95996 2303 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CEP295Q9C0D2 2601 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CCRL2O00421 344 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CXCL13O43927 109 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TFP02787 698 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CENPAP49450 140 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 BLVRAP53004 296 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 DKK4Q9UBT3 224 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CTLA4P16410 223 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CD79BP40259 229 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 LHX2P50458 406 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 POU4F3Q15319 338 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF485Q8NCK3 441 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 OR6X1Q8NH79 312 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 BCL7BQ9BQE9 202 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ISYNA1Q9NPH2 558 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35F4A4IF30 521 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 NPIPA2E9PIF3 369 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 NPIPA3F8WFD2 350 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 GABARAPO95166 117 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 IGHG1P01857 330 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 HCCSP53701 268 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CLDN15P56746 228 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 TRILQ7L0X0 811 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A9Q7RTY1 509 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 WDFY1Q8IWB7 410 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 LOC400499M0QZD8 3231 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms