RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	PLK3	Q9H4B4	646 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GWA3	101 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	PDLIM1	O00151	329 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	GPR171	O14626	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	WNT11	O96014	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	PRPS1	P60891	318 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	IFI44L	Q53G44	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF747	Q9BV97	191 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0B4J2E0	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GX12	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF208	O43345	1280 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TFPI	P10646	304 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	EPHA1	P21709	976 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	LIMS1	P48059	325 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	RIN1	Q13671	783 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	EFNB3	Q15768	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	PYURF	Q96I23	114 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM3-208	ENST00000489344		A0A087WUJ7	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344		A8MVM7	634 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ACOT8	O14734	319 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CRYAA	P02489	173 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	IFNW1	P05000	195 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PNMT	P11086	282 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CDH12	P55289	794 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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