RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 SIGLEC7Q9Y286 467 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 SPG11Q96JI7 2443 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 CD3EP07766 207 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 QDPRP09417 244 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 B4GALT1P15291 398 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 SLC9A3P48764 834 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 PRPS1P60891 318 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 CHRNB3Q05901 458 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 FMODQ06828 376 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 HIST3H3Q16695 136 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 OR9Q2Q8NGE9 314 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 MCHR2Q969V1 340 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 ZNF566Q969W8 418 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 KATNB1Q9BVA0 655 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 TXNIPQ9H3M7 391 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 NOX3Q9HBY0 568 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 AURKCQ9UQB9 309 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 RNF115Q9Y4L5 304 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 U3KQV3 271 aa10.59□□□□□ -0.71
NISCH-210ENST00000488157 DSCAMO60469 2012 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ROS1P08922 2347 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 UNC119BA6NIH7 251 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 AQP12BA6NM10 295 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SHISA9B4DS77 424 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 H7C1C5 153 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TNFRSF11BO00300 401 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ABCD4O14678 606 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IMPA2O14732 288 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 DHHO43323 396 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OR10H3O60404 316 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLC2A10O95528 541 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGHG1P01857 330 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGHMP01871 453 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HLA-HP01893 362 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CELA3BP08861 270 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PATE4P0C8F1 98 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CD53P19397 219 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CD40P25942 277 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ACVR1BP36896 505 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HMGA2P52926 109 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NR1H2P55055 460 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CLRN1P58418 232 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SMIM11AP58511 58 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RPL27P61353 136 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 LCN6P62502 163 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PIGFQ07326 219 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FLOT2Q14254 428 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PGBD2Q6P3X8 592 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SPATA24Q86W54 205 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NOXO1Q8NFA2 376 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF519Q8TB69 540 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 Q96M85 177 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FOXB1Q99853 325 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CHID1Q9BWS9 393 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NGBQ9NPG2 151 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF224Q9NZL3 707 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.58□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 DHRS12A0PJE2 317 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ATE1O95260 518 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RAF1P04049 648 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RAP2AP10114 183 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HOXC12P31275 282 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CDAP32320 146 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RPL4P36578 427 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 GSSP48637 474 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms