RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CAMK2DQ13557 499 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 KEAP1Q14145 624 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CARD17Q5XLA6 110 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 RTL6Q6ICC9 239 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZT83 130 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 GID4Q8IVV7 300 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 ASB10Q8WXI3 467 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 FN3KQ9H479 309 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TOR3AQ9H497 397 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CMC2Q9NRP2 79 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 CLN6Q9NWW5 311 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MED29Q9NX70 200 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 GALNT8Q9NY28 637 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 GLTPQ9NZD2 209 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 MOKQ9UQ07 419 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-210ENST00000486889 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0G2JNJ9 132 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZAR1LA6NP61 321 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 BHLHE40O14503 412 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DQA2P01906 255 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 PPP3CBP16298 524 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 IL32P24001 234 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ATP6V1E1P36543 226 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CAPGP40121 348 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 PCYT1AP49585 367 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ASCL1P50553 236 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GTF3C1Q12789 2109 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MED21Q13503 144 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MELKQ14680 651 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NRN1LQ496H8 165 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 LEG1Q6P5S2 330 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 OR4K13Q8NH42 304 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MUCL1Q96DR8 90 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 Q96M85 177 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 OR2M2Q96R28 347 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GPA33Q99795 319 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 WACQ9BTA9 647 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 EMC6Q9BV81 110 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NGBQ9NPG2 151 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 Q9UFV3 132 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RNF6Q9Y252 685 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SVILO95425 2214 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 IRGMA1A4Y4 181 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLC16A6O15403 523 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNHIT1O43257 154 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 PRODHO43272 600 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLC16A7O60669 478 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms