RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		5	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792		A0A087WUU8	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PTP4A3	O75365	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	UPK3A	O75631	287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	LYZL6	O75951	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF682	O95780	498 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CD8A	P01732	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PSKH1	P11801	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF43	P17038	809 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CBL	P22681	906 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MAGEA2	P43356	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	LIMS1	P48059	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NUDT2	P50583	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NR1H2	P55055	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	VLDLR	P98155	873 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PRKCD	Q05655	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PUDP	Q08623	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	DGCR6	Q14129	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ACKR1	Q16570	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PROX1	Q92786	737 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ACOT8	O14734	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	HS3ST1	O14792	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CASK	O14936	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SEC14L2	O76054	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	OR7A10	O76100	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINA1	P01009	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	IGHM	P01871	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RAF1	P04049	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	IFNW1	P05000	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CELA3B	P08861	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	RHCE	P18577	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MAK	P20794	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PTAFR	P25105	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MNAT1	P51948	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	CLDN17	P56750	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TUBA1B	P68363	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	TUBA4A	P68366	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	MS4A2	Q01362	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	FAP	Q12884	760 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PPA1	Q15181	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	SEC23B	Q15437	767 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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