RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.96□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.96□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.96□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A087WZY1 265 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 OR2M5A3KFT3 312 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 F8WDY8 70 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 HSPA12AO43301 675 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 OR2J2O76002 312 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 CLPSP04118 112 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 FREM3P0C091 2139 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 IDO1P14902 403 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 FUT1P19526 365 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 DRD5P21918 477 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 SLC34A1Q06495 639 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 PTGR1Q14914 329 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 OR1C1Q15619 314 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 SLC34A3Q8N130 599 aa4.95□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 OR2L13Q8N349 312 aa4.95□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.94□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 FRG2CA6NGY1 282 aa4.94□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 CLDN1O95832 211 aa4.94□□□□□ -1.62
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NHLRC3-205ENST00000485407 IL6P05231 212 aa4.94□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 SP1P08047 785 aa4.94□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 KRT16P08779 473 aa4.94□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 CT62P0C5K7 136 aa4.94□□□□□ -1.62
NHLRC3-205ENST00000485407 LAMP1P11279 417 aa4.94□□□□□ -1.62
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