RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	UGT1A9	O60656	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	RBBP9	O75884	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CD55	P08174	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PAX1	P15863	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PSMC3	P17980	439 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	BCL3	P20749	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SYT1	P21579	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAP2K2	P36507	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARR3	P36575	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAGEA2	P43356	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MED21	Q13503	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PON2	Q15165	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ITCH	Q96J02	903 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164		K7EQD1	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DCTN6	O00399	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	TNFSF11	O14788	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CLDN11	O75508	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	GJB5	O95377	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	HBE1	P02100	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	RHOC	P08134	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SERPINA6	P08185	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	GFAP	P14136	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MFAP2	P55001	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PAX9	P55771	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	PITPNA	Q00169	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DHODH	Q02127	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	SORT1	Q99523	831 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	RETN	Q9HD89	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	MLX	Q9UH92	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GIGYF2-238	ENST00000483164	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR5F1	O95221	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGHG1	P01857	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGG	P02679	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	HSD17B1	P14061	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	CD1D	P15813	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	EVI2B	P34910	448 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	TGM4	P49221	684 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRLHR	P49683	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69	2e-6	■■■□□ 15.6
GIGYF2-238	ENST00000483164	IL18R1	Q13478	541 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GIGYF2-238	ENST00000483164	GABRA6	Q16445	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms