RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB13A6NJU9 1138 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB4C9JG80 1138 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CDC42EP2O14613 210 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PDE5AO76074 875 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DANCRP0C864 163 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SAGP10523 405 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PAX7P23759 505 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 GPR4P46093 362 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A3P48764 834 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SEC23BQ15437 767 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 HIST3H3Q16695 136 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 FGD3Q5JSP0 725 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ARMC4Q5T2S8 1044 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RRM2BQ7LG56 351 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 OR13C2Q8NGS9 318 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MCUR1Q96AQ8 359 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SEPHS2Q99611 448 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MCIDASD6RGH6 385 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGHG1P01857 330 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 FABP3P05413 133 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SOD3P08294 240 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ACADSP16219 412 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CDH11P55287 796 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PGGHGQ32M88 737 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 LCN8Q6JVE9 175 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A25Q6T423 547 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 OAFQ86UD1 273 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CCDC36Q8IYA8 594 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 FAM169BQ8N8A8 192 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 OR52J3Q8NH60 311 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CLPTM1LQ96KA5 538 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A2Q96QD8 506 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF347Q96SE7 839 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 FOXB1Q99853 325 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MUC13Q9H3R2 512 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 LAMP3Q9UQV4 416 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CENPBD1B2RD01 187 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 E7EQL1 145 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 DHHO43323 396 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SMPD2O60906 423 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3-15P01624 115 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGLV1-44P01699 117 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 QDPRP09417 244 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT1P15291 398 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CBR1P16152 277 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 OMPP47874 163 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 LIMS1P48059 325 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CLRN1P58418 232 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 CTXN1P60606 82 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TAF11Q15544 211 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 C3orf36Q3SXR2 165 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MTX3Q5HYI7 312 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF813Q6ZN06 617 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 DHFR2Q86XF0 187 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 F8P00451 2351 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PLCE1Q9P212 2302 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ARID1AO14497 2285 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TMCC2O75069 709 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 PTP4A3O75365 173 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 IGHMP01871 453 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SMIM11AP58511 58 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SPIBQ01892 262 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZBED5Q49AG3 693 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 HDDC2Q7Z4H3 204 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SYT14Q8NB59 555 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 TMEM171Q8WVE6 324 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 MCHR2Q969V1 340 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 THTPAQ9BU02 230 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 SEC61A2Q9H9S3 476 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNF224Q9NZL3 707 aa18.24■□□□□ 0.51
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