RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471995.5

RBM5-215, Transcript of RNA binding motif protein 5, human

TSL 3

Gene RBM5, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM5-215	ENST00000471995	CALHM2	Q9HA72	323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	EHF	Q9NZC4	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TET1	Q8NFU7	2136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PTPRD	P23468	1912 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GSAP	A4D1B5	854 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	SLC17A2	O00624	439 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	BIRC5	O15392	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TBX19	O60806	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CRLF1	O75462	422 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	BANF1	O75531	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	OTX2	P32243	289 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GRIA1	P42261	906 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	SERPINB8	P50452	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PLK1	P53350	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RHOA	P61586	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	BCL2L1	Q07817	233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	DMTN	Q08495	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CUTC	Q9NTM9	273 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	EURL	Q9NYK6	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	NEU3	Q9UQ49	428 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PLXNA3	P51805	1871 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	LTBP2	Q14767	1821 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PATJ	Q8NI35	1801 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995		A0A0D9SEW6	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995		G3V3Y1	287 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ZNF253	O75346	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	SPAG7	O75391	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	STX11	O75558	287 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	VAPB	O95292	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RBP1	P09455	135 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ANXA3	P12429	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TAC1	P20366	129 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	DRD5	P21918	477 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GCA	P28676	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CD151	P48509	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MAX	P61244	160 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	NAA20	P61599	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	IL18R1	Q13478	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ITIH4	Q14624	930 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	POU6F1	Q14863	301 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CYTH1	Q15438	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PDK4	Q16654	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	C15orf32	Q32M92	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	NADK2	Q4G0N4	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RNLS	Q5VYX0	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	IFNE	Q86WN2	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	STK40	Q8N2I9	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	CCDC126	Q96EE4	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	C4orf36	Q96KX1	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RBBP8	Q99708	897 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	BBS2	Q9BXC9	721 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	PDF	Q9HBH1	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM5-215	ENST00000471995	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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