RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 EPHA6Q9UF33 1036 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 EML5Q05BV3 1969 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5H14A6NHG9 310 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM25EA8MYX2 175 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF17O60258 216 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GPANK1O95872 356 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 AKAIN1P0CW23 69 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 WASP42768 502 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNJ3P48549 501 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF234Q14588 700 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF227Q86WZ6 799 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GALNT16Q8N428 558 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5T3Q8NGG3 340 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ALG12Q9BV10 488 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGMQ9H3S5 423 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ETV7Q9Y603 341 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0D9SG52 128 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 HIDE1A8MVS5 230 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF18O76093 207 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 POU3F4P49335 361 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GAS6Q14393 721 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NR0B2Q15466 257 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF44Q7L0R7 432 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 VWCEQ96DN2 955 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM117AQ9C073 453 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 BIN3Q9NQY0 253 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RXFP3Q9NSD7 469 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM82A0PJX8 343 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM218A2RU14 115 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR6C76A6NM76 312 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ALOX12BO75342 701 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 UPK3AO75631 287 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LAG3P18627 525 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CMPK1P30085 196 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RORAP35398 523 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 DLSTP36957 453 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RFC3P40938 356 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 DCDP81605 110 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC157Q569K6 752 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB12Q6IQ22 244 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM205Q6UW68 189 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMIEQ8NEW7 156 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXN4Q96NZ1 517 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 MICU1Q9BPX6 476 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBP1Q9H171 429 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 DCTN6O00399 190 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 BRINP1O60477 761 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGA5P08648 1049 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 VIPR2P41587 438 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP1B3P54709 279 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR7A5Q15622 319 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FHL5Q5TD97 284 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SVBPQ8N300 66 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf198Q9H425 327 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB19A4D1S5 217 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF222A6NCQ9 220 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM200CA6NKL6 621 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FADS1O60427 444 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 AKR7A3O95154 331 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CD8AP01732 235 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 AMY2AP04746 511 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS3P35030 304 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PGDP52209 483 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 IRF4Q15306 451 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NKPD1Q17RQ9 610 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms