RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468254.5

CEP170-211, Transcript of centrosomal protein 170, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CEP170, Length 2,972 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170-211ENST00000468254 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR2L13Q8N349 312 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SVOPQ8N4V2 548 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 LRTM2Q8N967 370 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 PLPP5Q8NEB5 264 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 GPX8Q8TED1 209 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NAT14Q8WUY8 206 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RAB1CQ92928 201 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 EPYCQ99645 322 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 C12orf10Q9HB07 376 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 M0R296 226 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 UPK1AO00322 258 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 LCE2BO14633 110 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 HAT1O14929 419 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ARPC2O15144 300 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RAD51DO75771 328 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 IGHV2-70P01814 119 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 GDF5P43026 501 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 IER3P46695 156 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 MS4A2Q01362 244 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NFYCQ13952 458 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RGNQ15493 299 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NDUFA9Q16795 377 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 VMACQ2NL98 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RFX4Q33E94 735 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ZNF385BQ569K4 471 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 AGAP6Q5VW22 663 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 DHFR2Q86XF0 187 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NAT6Q93015 286 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR14A2Q96R54 314 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ARHGDIGQ99819 225 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 CHID1Q9BWS9 393 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TM2D2Q9BX73 214 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 TAC3Q9UHF0 121 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ANTXRLA6NF34 631 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 A8MX80 341 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 PROB1E7EW31 1015 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 PPIAL4DF5H284 164 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 F8VVB4 439 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 F8VWA3 439 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 H7C1Q1 480 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 NR5A2O00482 541 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ACOX3O15254 700 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 EMC8O43402 210 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OR2J3O76001 311 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 BMP10O95393 424 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 EML2O95834 649 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 IFNA14P01570 189 aa3.12□□□□□ -1.91
CEP170-211ENST00000468254 GSTT2P0CG29 244 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms