RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461239.2

ECHDC1-212, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-212ENST00000461239 HPCAP84074 193 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 HOXC5Q00444 222 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 EPS8Q12929 822 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 QPRTQ15274 297 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 DUSP7Q16829 419 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 RAET1LQ5VY80 246 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 UEVLDQ8IX04 471 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 BBS10Q8TAM1 723 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SFXN2Q96NB2 322 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PIGQQ9BRB3 760 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CENPOQ9BU64 300 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CALML5Q9NZT1 146 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 NLKQ9UBE8 527 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 A0A0J9YW62 118 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 A0A1B0GUH1 482 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 M0QX08 132 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CLDN1O95832 211 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TGM6O95932 706 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 OPN1SWP03999 348 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF17P17021 662 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TACR3P29371 465 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 RYKP34925 604 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CPOXP36551 454 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 NUDT2P50583 147 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC7A2P52569 658 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF136P52737 540 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 NUP107P57740 925 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SRYQ05066 204 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 RBBP4Q09028 425 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PMPCAQ10713 525 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 BCL2A1Q16548 175 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CYP51A1Q16850 503 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 LIN52Q52LA3 116 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 WLSQ5T9L3 541 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 AAGABQ6PD74 315 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CCDC80Q76M96 950 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 RRM2BQ7LG56 351 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 LACC1Q8IV20 430 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SMYD1Q8NB12 490 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TAMM41Q96BW9 452 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ACER3Q9NUN7 267 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 GID8Q9NWU2 228 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 IFT52Q9Y366 437 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 TMEM247A6NEH6 219 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CXorf65A6NEN9 183 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CFAP73A6NFT4 308 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 C5orf58C9J3I9 102 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 FAAHO00519 579 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 ADAMDEC1O15204 470 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 WDR1O75083 606 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 DCTN3O75935 186 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SEC14L2O76054 403 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 NUDT14O95848 222 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SPARCP09486 303 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 KLK2P20151 261 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 HTR2AP28223 471 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 RAD52P43351 418 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC6A8P48029 635 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms