RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455371.5

PITRM1-208, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-208ENST00000455371 ACKR1Q16570 336 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MSMPQ1L6U9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 PGGHGQ32M88 737 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 UEVLDQ8IX04 471 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 NINJ1Q92982 152 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MBD6Q96DN6 1003 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OXGR1Q96P68 337 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CCL19Q99731 98 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CIB1Q99828 191 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SMR3AQ99954 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 FOXC2Q99958 501 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 BDH2Q9BUT1 245 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OR10A4Q9H209 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 GPR35Q9HC97 309 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 RCE1Q9Y256 329 aa6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SLC35F4A4IF30 521 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TRIM64BA6NI03 449 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 E7EQL1 145 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 H7C1C5 153 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SOCS2O14508 198 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CDC42EP2O14613 210 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IMPA2O14732 288 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OR7A10O76100 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OR5F1O95221 314 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 GOSR1O95249 250 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CST1P01037 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CD8AP01732 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CD3EP07766 207 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 PATE4P0C8F1 98 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ADORA3P0DMS8 318 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 B4GALT1P15291 398 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ZNF43P17038 809 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CD40P25942 277 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CALCRP30988 508 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CDKN1AP38936 164 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 AQP2P41181 271 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MAGEA2P43356 314 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 PTH2RP49190 550 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 NR1H2P55055 460 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CDH11P55287 796 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 BIDP55957 195 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 LCN6P62502 163 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SELENOWP63302 87 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ADAM8P78325 824 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MYBPC1Q00872 1141 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 PMS2P3Q13401 168 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MED21Q13503 144 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SEC23BQ15437 767 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IFI44LQ53G44 452 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 Q5PR19 223 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OTPQ5XKR4 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CBR4Q8N4T8 237 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 SCAIQ8N9R8 606 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 OR5J2Q8NH18 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 TMEM239Q8WW34 195 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 MUS81Q96NY9 551 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 EPYCQ99645 322 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 ASPNQ9BXN1 380 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 Q9H521 79 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 FKRPQ9H9S5 495 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 CRLF2Q9HC73 371 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 DLL4Q9NR61 685 aa6.65□□□□□ -1.34
PITRM1-208ENST00000455371 VNN3Q9NY84 501 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms