RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 HLA-FP30511 346 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 HOXA9P31269 272 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ARL2P36404 184 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 GPD2P43304 727 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 CRKLP46109 303 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 XKP51811 444 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PRPS1P60891 318 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ACTA1P68133 377 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 CDK3Q00526 305 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 POU2AF1Q16633 256 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 TIGD3Q6B0B8 471 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 CD164L2Q6UWJ8 174 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 ACOT4Q8N9L9 421 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM75Q8N9X5 138 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 HMGB4Q8WW32 186 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 HSD17B8Q92506 261 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 FAR2Q96K12 515 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 FAM167AQ96KS9 214 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 MRGPRX1Q96LB2 322 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 GBP5Q96PP8 586 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PANX3Q96QZ0 392 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 OR4C12Q96R67 309 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 AMELYQ99218 206 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 PITPNM3Q9BZ71 974 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 NARFLQ9H6Q4 476 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 COG4Q9H9E3 785 aa-1.05□□□□□ -2.58
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SNORD57-201ENST00000448188 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 CBLN4Q9NTU7 201 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 GDE1Q9NZC3 331 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 SLC25A13Q9UJS0 675 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF225Q9UK10 706 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PADI3Q9ULW8 664 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 NPIPA1Q9UND3 350 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 MAPRE3Q9UPY8 281 aa-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 NRCAMQ92823 1304 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1B0GVL5 298 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 OR51F1A6NGY5 319 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 F5H5P2 479 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 J3KTA2 159 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 FBP2O00757 339 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 SLC16A6O15403 523 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF264O43296 627 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 TXNL1O43396 289 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PLPP2O43688 288 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 KLRC4O43908 158 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 PRAF2O60831 178 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-1.06□□□□□ -2.581e-323■□□□□ 9.3
SNORD57-201ENST00000448188 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 STK17BO94768 372 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 MT-ND3P03897 115 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 SCTP09683 121 aa-1.06□□□□□ -2.58
SNORD57-201ENST00000448188 OR8U9P0C7N5 309 aa-1.06□□□□□ -2.58
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