RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 ERVK-16P61578 105 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 BCL2A1Q16548 175 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 CXorf58Q96LI9 332 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 GHITMQ9H3K2 345 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0G2JMP0 313 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TBX19O60806 448 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 RIMKLAQ8IXN7 391 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 CDS1Q92903 461 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR51J1Q9H342 316 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SPANXA1Q9NS26 97 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ASB1Q9Y576 335 aa10.74□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GTL3 188 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SERPINA5P05154 406 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SERPINA2P20848 420 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ERVFRD-1P60508 538 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZSR6 202 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ALG8Q9BVK2 526 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087X0M5 115 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GX30 115 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 F6UZH7 168 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 I3L1I5 382 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SIAH2O43255 324 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SCG5P05408 212 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NR0B2Q15466 257 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 FBXW12Q6X9E4 464 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 PDZD3Q86UT5 571 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SPTSSAQ969W0 71 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV27A0A087WT01 109 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NTSR1P30989 418 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 GIPRP48546 466 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 AESQ08117 197 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 FAM198BQ6UWH4 519 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR51Q1Q8NH59 317 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 PECRQ9BY49 303 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 IL23AQ9NPF7 189 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WZY1 265 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TAPBPO15533 448 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NCR1O76036 304 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR2B8PP59922 312 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 LCN10Q6JVE6 187 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 FIBINQ8TAL6 211 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 IKZF5Q9H5V7 419 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NPTNQ9Y639 398 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SLC10A3P09131 477 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TIMP2P16035 220 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 GPX2P18283 190 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 DDCP20711 480 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 PTAFRP25105 342 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 MC5RP33032 325 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 EMP3P54852 163 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 DSC1Q08554 894 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TAF9Q16594 264 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR5W2Q8NH69 310 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ELMOD3Q96FG2 381 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SFRP2Q96HF1 295 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.73□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NSA2O95478 260 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ABHD16AO95870 558 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 CDKN3Q16667 212 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 CMIPQ8IY22 773 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 OR52N1Q8NH53 320 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 RAB3CQ96E17 227 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ELP4Q96EB1 424 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 NT5DC2Q9H857 520 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 CD207Q9UJ71 328 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf72A6NCS6 295 aa10.72□□□□□ -0.69
CCBE1-202ENST00000439986 H0Y980 276 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms