RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TCAPO15273 167 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 UGDHO60701 494 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALT2O60909 372 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DIRAS3O95661 229 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOCP08134 193 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 SFTA3P0C7M3 94 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2F1P10589 423 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR3P46089 330 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CXADRP78310 365 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTN1Q12860 1018 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZNB5 142 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 REC114Q7Z4M0 266 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED6Q8WW62 240 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB3CQ96E17 227 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NEURL3Q96EH8 262 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FKRPQ9H9S5 495 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CPED1A4D0V7 1026 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD17A6NE02 478 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GGT3PA6NGU5 568 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF16O43320 207 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL6IP5O75915 188 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH1CP00326 375 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ND4LP03901 98 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMP2P16035 220 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5EP21589 574 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNGR2P38484 337 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CASRP41180 1078 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ST8SIA6P61647 398 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALNT1Q00973 533 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF345Q14585 488 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53I3Q53FA7 332 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPAL3Q6P499 406 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PARGQ86W56 976 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EID2Q8N6I1 236 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NEIL2Q969S2 332 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MISP3Q96FF7 219 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO1933Q9H354 126 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DAOP14920 347 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARF5P84085 180 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 NRMQ8IXM6 262 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T33Q8NG76 320 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGXQ8TBF5 258 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 APMAPQ9HDC9 416 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP26Q9NRE1 261 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM72A0PK05 275 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-203ENST00000439720 GRM6O15303 877 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 EMC8O43402 210 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 JMJD7P0C870 316 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ACKR3P25106 362 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP4P27487 766 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB5CP51148 216 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP1B3P54709 279 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R20P59543 309 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOAP61586 193 aa7.67□□□□□ -1.18
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