RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPAS1Q99742 590 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAREM1Q9H706 876 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APMAPQ9HDC9 416 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA2Q9UM82 520 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B9D1Q9UPM9 204 aa16.89■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS13O14921 159 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2T1O43869 369 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6A2O95222 327 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THEM6Q8WUY1 208 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST8SIA1Q92185 356 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A6Q92536 515 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPRTQ96BW1 309 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALPK2Q86TB3 2170 aa16.88■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FTCDNL1E5RQL4 147 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDCD5O14737 125 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBL3O95164 117 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHMP01871 453 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFIP05156 583 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN20P56880 219 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TATDN3Q17R31 274 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q499Y3 187 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP69Q49AA0 526 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCN10Q6JVE6 187 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTOSQ8NHW6 89 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF671Q8TAW3 534 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EDAQ92838 391 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHYHO14832 338 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC43A1O75387 559 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA10O75578 1167 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCVRNP35243 200 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR176Q14439 515 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8K3Q8NH51 312 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMELYQ99218 206 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRB3Q9BUF7 120 aa16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GTH9 108 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFITM5A6NNB3 132 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIPO00170 330 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-DQA2P01906 255 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAGAP17050 411 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF138Q8WVD3 245 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMEPA1Q969W9 287 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf44Q96CB5 159 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED11Q9P086 117 aa16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YKT6O15498 198 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A7O60669 478 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL11P20809 199 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HLA-DMAP28067 261 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A1P30531 599 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2NLQ5JXB2 153 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF19Q5T6S3 580 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HES5Q5TA89 166 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HACD4Q5VWC8 232 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTPQ5XKR4 325 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BICRALQ6AI39 1079 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM205Q6UW68 189 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARSKQ6UWY0 536 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6S1Q8NH40 331 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFI44Q8TCB0 444 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSMAFQ92636 917 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMTM3Q96MX0 182 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCG5Q9H222 651 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPB2A8KAH6 182 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTLA4P16410 223 aa16.85■□□□□ 0.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMP15P51511 669 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms