RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 P2RY4P51582 365 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 RLIMQ9NVW2 624 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 KNL1Q8NG31 2342 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 LRP5O75197 1615 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SCDO00767 359 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 NDUFA2O43678 99 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ABOP16442 354 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CASP6P55212 293 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CLDN19Q8N6F1 224 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 NUP43Q8NFH3 380 aa5.99□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PPQ1 181 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 CD82P27701 267 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 LINC00303Q3SY05 128 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM3CQ92520 227 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 RASL12Q9NYN1 266 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 H7BYZ3 331 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 DVL2O14641 736 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 Q6ZSR9 355 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC35G3Q8N808 338 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 MS4A10Q96PG2 267 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 C2orf78A6NCI8 922 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SMIM12Q96EX1 92 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 DPH1Q9BZG8 443 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 M1APQ8TC57 530 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 GPX8Q8TED1 209 aa5.98□□□□□ -1.45
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SBNO1-202ENST00000420886 ADRA1AP35348 466 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ERV3-1Q14264 604 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 DECR1Q16698 335 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 OR52D1Q9H346 318 aa5.98□□□□□ -1.45
SBNO1-202ENST00000420886 FAM183AA6NL82 134 aa5.98□□□□□ -1.45
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