RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 SYT14Q8NB59 555 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PELI1Q96FA3 418 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 C5orf34Q96MH7 638 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 GPR87Q9BY21 358 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MROQ9BYG7 248 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 CDCP1Q9H5V8 836 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 MARCH7Q9H992 704 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 SACM1LQ9NTJ5 587 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.03□□□□□ -0.8
CTXN3-202ENST00000395322 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 LIPT2A6NK58 231 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 E9PI62 339 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 H3BML4 177 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 CTDSP2O14595 271 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SC5DO75845 299 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 CELA2AP08217 269 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 EDNRAP25101 427 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TNFSF8P32971 234 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 GLO1Q04760 184 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM91Q6ZNR0 172 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TRILQ7L0X0 811 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 PXKQ7Z7A4 578 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 RAB43Q86YS6 212 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ABHD4Q8TB40 342 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ASB17Q8WXJ9 295 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 GHSRQ92847 366 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ARL5BQ96KC2 179 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TSSK2Q96PF2 358 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 COPS3Q9UNS2 423 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 B9D1Q9UPM9 204 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SDK2Q58EX2 2172 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 EML6Q6ZMW3 1958 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 VCANP13611 3396 aa10.02□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF879B4DU55 563 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 LRRTM2O43300 516 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TBX1O43435 398 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 PFDN1O60925 122 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 HLA-DQA2P01906 255 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINA7P05543 415 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 HCCSP53701 268 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 HSF1Q00613 529 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 MYBPHQ13203 477 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 DNASE1L3Q13609 305 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 OXA1LQ15070 435 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 HBMQ6B0K9 141 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF544Q6NX49 715 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 CEACAM19Q7Z692 300 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 LAX1Q8IWV1 398 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 POC1BQ8TC44 478 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ASB10Q8WXI3 467 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 THRSPQ92748 146 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ITPKCQ96DU7 683 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM41AQ96HV5 264 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 SPRY4Q9C004 299 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.01□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 B4DXG7 233 aa10□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 C9orf172C9J069 976 aa10□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 MS4A18H0YCH9 400 aa10□□□□□ -0.81
CTXN3-202ENST00000395322 DCTN6O00399 190 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms