RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 RETP07949 1114 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF30P17039 623 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC2A5P22732 501 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 AQP6Q13520 282 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 LCE1CQ5T751 118 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2A2Q6IF42 318 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM40Q6P9F5 258 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1L4Q8NGR5 311 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CD300LFQ8TDQ1 290 aa2.27□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR8B4Q96RC9 309 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FMO2Q99518 471 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SORT1Q99523 831 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CCT7Q99832 543 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MFFQ9GZY8 342 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD19PQ9H560 264 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 AZI2Q9H6S1 392 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NECAP2Q9NVZ3 263 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGLQ9Y2B2 252 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NFASCO94856 1347 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CDHR2Q9BYE9 1310 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GVI7 797 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SGK1O00141 431 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 BGLAPP02818 100 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GZMAP12544 262 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MNAT1P51948 309 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GBE1Q04446 702 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ENPEPQ07075 957 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF77Q15935 545 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC31Q6UY01 552 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 H2AFVQ71UI9 128 aa2.26□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BHLHE23Q8NDY6 225 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OR13C2Q8NGS9 318 aa2.26□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM10Q96HG1 83 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GON7Q9BXV9 100 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC40Q9H9A6 602 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF823P16415 610 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 OMGP23515 440 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 RORAP35398 523 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B2P37059 387 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 VHLP40337 213 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SSR1P43307 286 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 RPS21P63220 83 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD21Q4G0X4 260 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 SDR42E1Q8WUS8 393 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SGK3Q96BR1 496 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 MED8Q96G25 268 aa2.25□□□□□ -2.05
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RABGGTB-202ENST00000370826 TCEANC2Q96MN5 208 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TSNARE1Q96NA8 513 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 NPY6RQ99463 290 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 RARRES2Q99969 163 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC39A3Q9BRY0 314 aa2.25□□□□□ -2.05
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