RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TM9SF2Q99805 663 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 BCL7BQ9BQE9 202 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 MOKQ9UQ07 419 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC4Q9Y296 219 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF407Q9C0G0 2248 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FRYQ5TBA9 3013 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD9O00233 223 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 EFSO43281 561 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FZD7O75084 574 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CELA3AP09093 270 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 OR2T7P0C7T2 308 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PSKH1P11801 424 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CTLA4P16410 223 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CELP19835 753 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CENPAP49450 140 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 BIDP55957 195 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 RAC1P63000 192 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FMODQ06828 376 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 RPTNQ6XPR3 784 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 POMGNT2Q8NAT1 580 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 OR2T27Q8NH04 317 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FAM173AQ9BQD7 235 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DCSTAMPQ9H295 470 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ISYNA1Q9NPH2 558 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 KLK13Q9UKR3 277 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CSAG2Q9Y5P2 127 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa13.74□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC13O75165 2243 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PRR32B1ATL7 298 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 AHCYL1O43865 530 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 GFRA3O60609 400 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SP1P08047 785 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF17P17021 662 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35A1P78382 337 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 INSL4Q14641 139 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 VASNQ6EMK4 673 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 TIGD4Q8IY51 512 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 UFD1Q92890 307 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 UCN2Q96RP3 112 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FANCFQ9NPI8 374 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 OR5H15A6NDH6 313 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FAM166BA8MTA8 275 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SEC14L5O43304 696 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 MPZL1O95297 269 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PMS2P2O95744 297 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 RRADP55042 308 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN15P56746 228 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SOX8P57073 446 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 H3F3AP84243 136 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ACSM1Q08AH1 577 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CAMK2DQ13557 499 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ADCK1Q86TW2 530 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 UEVLDQ8IX04 471 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 MDS2Q8NDY4 140 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FDCSPQ8NFU4 85 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 KCNK17Q96T54 332 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 STUB1Q9UNE7 303 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PNV4 684 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 AQP7P3A6NL99 342 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ENPP1P22413 925 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINB10P48595 397 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 CD97P48960 835 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ACTC1P68032 377 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 ACTA1P68133 377 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 FABP5Q01469 135 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 MEP1BQ16820 701 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.72□□□□□ -0.21
CASQ1-201ENST00000368078 SFXN2Q96NB2 322 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms