RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MCIDASD6RGH6 385 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SMPD2O60906 423 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 UBOX5O94941 541 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CELA3BP08861 270 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 B4GALT1P15291 398 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM8P78325 824 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MYBPC1Q00872 1141 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DGCR6Q14129 220 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ALG10Q5BKT4 473 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LRFN4Q6PJG9 635 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A25Q6T423 547 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 OR52J3Q8NH60 311 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 OR51A7Q8NH64 312 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HTRA1Q92743 480 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PERPQ96FX8 193 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CLPTM1LQ96KA5 538 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NOX3Q9HBY0 568 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R1Q9NYW7 299 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF224Q9NZL3 707 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 POFUT2Q9Y2G5 429 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TCRBV5S2A0A599 114 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV1-44P01699 117 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IGHG1P01857 330 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CECR9P0C854 216 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CAPZA2P47755 286 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CLRN1P58418 232 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A2Q01362 244 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SPIBQ01892 262 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF813Q6ZN06 617 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF627Q7L945 461 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MDP1Q86V88 176 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SYT14Q8NB59 555 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM171Q8WVE6 324 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SEPHS2Q99611 448 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FUZQ9BT04 418 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TXNIPQ9H3M7 391 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 POU2F3Q9UKI9 436 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MOKQ9UQ07 419 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PLCE1Q9P212 2302 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 USF3Q68DE3 2245 aa13□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HTR3EA5X5Y0 456 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NPIPB13A6NJU9 1138 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NPIPB4C9JG80 1138 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DHHO43323 396 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV3-15P01624 115 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CD8AP01732 235 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IGHMP01871 453 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-HP01893 362 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 FABP3P05413 133 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 QDPRP09417 244 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CBR1P16152 277 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ACADSP16219 412 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CALCRP30988 508 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 OMPP47874 163 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LIMS1P48059 325 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9A3P48764 834 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 PTH2RP49190 550 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 DAP3P51398 398 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 CTXN1P60606 82 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 HIST3H3Q16695 136 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 OAFQ86UD1 273 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 MCHR2Q969V1 340 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 RADILQ96JH8 1075 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN32Q96QS1 320 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 GPA33Q99795 319 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CSAG1-201ENST00000361211 B3GNT2Q9NY97 397 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms