RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360779.3

SDCBP2-202, Transcript of syndecan binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2, Length 1,519 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNHIT1O43257 154 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC16A7O60669 478 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CYTIPO60759 359 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RAB36O95755 333 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 HLA-DQA2P01906 255 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CDK1P06493 297 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SMIM18P0DKX4 95 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC25A1P53007 311 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RUNX1T1Q06455 604 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC17A1Q14916 467 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 POU4F3Q15319 338 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SVOPQ8N4V2 548 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 EXD3Q8N9H8 876 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ABHD3Q8WU67 409 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 LGALS12Q96DT0 336 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TMEM80Q96HE8 168 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 GPR137Q96N19 417 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TSSK2Q96PF2 358 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RBP7Q96R05 134 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SNX18Q96RF0 628 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TRIB1Q96RU8 372 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TEAD3Q99594 435 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 DUSP21Q9H596 190 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 EMC3Q9P0I2 261 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.8□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 A6NHS1 94 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC22A20A6NK97 555 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 MYL12AP19105 171 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CRABP1P29762 137 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 GSTT1P30711 240 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RAB40BQ12829 278 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TMED1Q13445 227 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR6X1Q8NH79 312 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ALG12Q9BV10 488 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NUAK2Q9H093 628 aa14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CCDC182A6NF36 153 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 GLCEO94923 617 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FCGR2AP12318 317 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NR2C1P13056 603 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC2A5P22732 501 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CSNK1A1P48729 337 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 POU4F2Q12837 409 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NEDD8Q15843 81 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 AAED1Q7RTV5 226 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NSMAFQ92636 917 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 MOKQ9UQ07 419 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FKBP7Q9Y680 259 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FREM3P0C091 2139 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.78□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR14I1A6ND48 311 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF716A6NP11 495 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 GPR171O14626 319 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 WISP2O76076 250 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TPOP07202 933 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SFTPCP11686 197 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 PTGS2P35354 604 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 MAP2K4P45985 399 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 TUBA4AP68366 448 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FMODQ06828 376 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KLRB1Q12918 225 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 SPARTQ8N0X7 666 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR6V1Q8N148 313 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 Q8NA96 180 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 RNF128Q8TEB7 428 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 KCNK17Q96T54 332 aa14.77□□□□□ -0.04
SDCBP2-202ENST00000360779 DDOQ99489 341 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms