RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 NAA40Q86UY6 237 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 MISPQ8IVT2 679 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PMS2P2O95744 297 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SEC13P55735 322 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RUNX3Q13761 415 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 IRF4Q15306 451 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CST6Q15828 149 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 AMZ1Q400G9 498 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SLC35A4Q96G79 324 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 AICDAQ9GZX7 198 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ADAM29Q9UKF5 820 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ETV7Q9Y603 341 aa15.32■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 XRCC3O43542 346 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PPT1P50897 306 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 REEP5Q00765 189 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CCDC107Q8WV48 283 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 MRI1Q9BV20 369 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SEC11CQ9BY50 192 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 C1orf198Q9H425 327 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 KLHL31Q9H511 634 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PELI2Q9HAT8 420 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PR48 441 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 FGF16O43320 207 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RPN2P04844 631 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ERGP11308 486 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 FCARP24071 287 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SOX2P48431 317 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CSNK1G2P78368 415 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR4K13Q8NH42 304 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SCN2AQ99250 2005 aa15.31■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SULT2B1O00204 365 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 IMPA2O14732 288 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CD1AP06126 327 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A4P12235 298 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ATP1B3P54709 279 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CDK20Q8IZL9 346 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR2L13Q8N349 312 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 CDS1Q92903 461 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RAB7BQ96AH8 199 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 MOAP1Q96BY2 351 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 KXD1Q9BQD3 176 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 WDR45Q9Y484 360 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GTI1 187 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 TXNL1O43396 289 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 KCNAB3O43448 404 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ITGB2P05107 769 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR1Q1Q15612 314 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR7A5Q15622 319 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 GPR174Q9BXC1 333 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RNF122Q9H9V4 155 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 RD3LP0DJH9 198 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 FOLR2P14207 255 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ABCD3P28288 659 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 GRPRP30550 384 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 SLC9A5Q14940 896 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.3■□□□□ 0.04
GDE1-201ENST00000353258 ACER2Q5QJU3 275 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms