RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MSANTD3Q96H12 275 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LRFN5Q96NI6 719 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ADOQ96SZ5 270 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 S1PR5Q9H228 398 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FBRSQ9HAH7 460 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NPTNQ9Y639 398 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GUH1 482 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SCDO00767 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF749O43361 778 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ICOSLGO75144 302 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TGM6O95932 706 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PDGFAP04085 211 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD1AP06126 327 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PROS1P07225 676 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR1D4P47884 311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 EFNA3P52797 238 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RAG2P55895 527 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FUT7Q11130 342 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OPCMLQ14982 345 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AANATQ16613 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MDGA2Q7Z553 956 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC43A2Q8N370 569 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MEIOBQ8N635 442 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR8S1Q8NH09 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 NSMAFQ92636 917 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM106AQ96A25 262 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MIB2Q96AX9 1013 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HAVCR1Q96D42 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OMA1Q96E52 524 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TGM7Q96PF1 710 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GINS4Q9BRT9 223 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN4O14493 209 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF264O43296 627 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 HLA-DQA2P01906 255 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IFI6P09912 130 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 FNTBP49356 437 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A1P53007 311 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF117Q03924 483 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 IL10RAQ13651 578 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MELKQ14680 651 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ETFDHQ16134 617 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MEP1BQ16820 701 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 WDR38Q5JTN6 314 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 SLC6A19Q695T7 634 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 MARCH3Q86UD3 253 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRR-202ENST00000342084 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
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