RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 EMC6Q9BV81 110 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PLSCR2Q9NRY7 297 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 HAO2Q9NYQ3 351 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 AQP7O14520 342 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB36O95755 333 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TFAP2AP05549 437 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GSTT1P30711 240 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 C3AR1Q16581 482 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NADK2Q4G0N4 442 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 EXD3Q8N9H8 876 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PROKR2Q8NFJ6 384 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR51L1Q8NGJ5 315 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR51G2Q8NGK0 314 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6X1Q8NH79 312 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TSSK2Q96PF2 358 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 LUZP4Q9P127 313 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 MOKQ9UQ07 419 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35F4A4IF30 521 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 AHCYL1O43865 530 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 APOL3O95236 402 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHG1P01857 330 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DCKP27707 260 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CLDN17P56750 224 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6V1Q8N148 313 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT14Q8NB59 555 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6K6Q8NGW6 343 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 NUAK2Q9H093 628 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP7Q9Y680 259 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF726A6NNF4 738 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CYTIPO60759 359 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 GLCEO94923 617 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 POU4F2Q12837 409 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG12Q9BV10 488 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM14Q9GZV8 571 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-201ENST00000298838 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF716A6NP11 495 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 DCTN6O00399 190 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CRABP1P29762 137 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PYCR1P32322 319 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CLRN1P58418 232 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 GGTLC2Q14390 218 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 NEDD8Q15843 81 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 SHFQ7M4L6 423 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF128Q8TEB7 428 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD3Q8WU67 409 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 SARAFQ96BY9 339 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CRELD1Q96HD1 420 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 RERGLQ9H628 205 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 BATF3Q9NR55 127 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A7O60669 478 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PGA4P0DJD7 388 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PGA3P0DJD8 388 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL12AP19105 171 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PCMT1P22061 227 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK2DQ13557 499 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01590Q5TEZ4 76 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 XAF1Q6GPH4 301 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 DNM1P34Q6PK57 102 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNRF4Q8WWF5 429 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 PRRG4Q9BZD6 226 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOT13Q9NPJ3 140 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 ADRA2AP08913 450 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 SBK2P0C263 348 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 CTLA4P16410 223 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP2K4P45985 399 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-201ENST00000298838 FNDC9Q8TBE3 224 aa18.44■□□□□ 0.54
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