RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 OR5H15A6NDH6 313 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 EPOPA6NHQ4 379 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HCRTR1O43613 425 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PIP5K1CO60331 668 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ABHD16AO95870 558 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SMUG1Q53HV7 270 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GPR22Q99680 433 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GM2AP17900 193 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GABRR1P24046 479 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GIFP27352 417 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TEAD1P28347 426 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GNRHRP30968 328 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF136P52737 540 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OXA1LQ15070 435 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CMIPQ8IY22 773 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LHX9Q9NQ69 397 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 INIPQ9NRY2 104 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 A0A0U1RQK1 487 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PPK0 400 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 A8MXE2 369 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 G3V3Y1 287 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 I6L893 689 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SDHDO14521 159 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SOX2P48431 317 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ARSDP51689 593 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 DPTQ07507 201 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RAB31Q13636 194 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GK3PQ14409 553 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 VAMP3Q15836 100 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OR10K2Q6IF99 312 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GABRG3Q99928 467 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 RHCGQ9UBD6 479 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ETFAP13804 333 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HSD17B1P14061 328 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 GNB3P16520 340 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 EMX2Q04743 252 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SPOCK1Q08629 439 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ODF4Q2M2E3 257 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TOR2AQ5JU69 321 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 AFMIDQ63HM1 303 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 NAA40Q86UY6 237 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HINT2Q9BX68 163 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 APMAPQ9HDC9 416 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 EMC7Q9NPA0 242 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 AIG1Q9NVV5 245 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 VNN3Q9NY84 501 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 TCFL5Q9UL49 500 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 A0A0U1RQS6 177 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CLDN24A6NM45 220 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HTR3BO95264 441 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 APOA2P02652 100 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CHRM4P08173 479 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ARSBP15848 533 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CPT2P23786 658 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ETV4P43268 484 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 CLDN17P56750 224 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SKA3Q8IX90 412 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 ZNF561Q8N587 486 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 FBXO27Q8NI29 283 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 MITD1Q8WV92 249 aa7.2□□□□□ -1.26
USP3-201ENST00000268049 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms