RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.46■□□□□ 0.55
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM129A0AVI4 362 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ALDOBP05062 364 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CD82P27701 267 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OTX2P32243 289 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 LHFPL3Q86UP9 236 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF527Q8NB42 609 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 UXS1Q8NBZ7 420 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NKD1Q969G9 470 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 RNFT2Q96EX2 444 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PINK1Q9BXM7 581 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 GPR87Q9BY21 358 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 H2AFB2P0C5Z0 115 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IGF2-ASQ6U949 168 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PRR22Q8IZ63 422 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M3Q8NGP4 307 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ELMOD3Q96FG2 381 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IMMP1LQ96LU5 166 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 G6PC3Q9BUM1 346 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ACAD8Q9UKU7 415 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 GPR52Q9Y2T5 361 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PCSK5Q92824 1860 aa18.45■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DPB1P04440 258 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 GUSBP08236 651 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PITPNBP48739 271 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SSPNQ14714 243 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DECR1Q16698 335 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SAMD12Q8N8I0 201 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 COPZ2Q9P299 210 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DVL2O14641 736 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CELA2AP08217 269 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PRKAR1BP31321 381 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM11AP58511 58 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IL10RAQ13651 578 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF836Q6ZNA1 936 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DTX1Q86Y01 620 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TOMM5Q8N4H5 51 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 BVESQ8NE79 360 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD1Q96SE0 405 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa18.44■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS44E7EML9 344 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 TO15178 435 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 HPXP02790 462 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 C4BPBP20851 252 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 GAS1P54826 345 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NUBPLQ8TB37 319 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 PMM1Q92871 262 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MED9Q9NWA0 146 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FREM2Q5SZK8 3169 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 L7N2F9 121 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IL33O95760 270 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 THBS1P07996 1170 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CD3GP09693 182 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SLC36A2Q495M3 483 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SFRP5Q5T4F7 317 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 IL22RA1Q8N6P7 574 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ELP5Q8TE02 316 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EGLN3Q9H6Z9 239 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 ISYNA1Q9NPH2 558 aa18.43■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PRQ8 180 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 MASP2O00187 686 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 SIGLEC5O15389 551 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 KDM4BO94953 1096 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 FGF2P09038 288 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 LIMS3P0CW19 117 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 LIMS4P0CW20 117 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 CXCL2P19875 107 aa18.42■□□□□ 0.54
UBE2B-201ENST00000265339 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms