RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029476.8

Sec22b-201, Transcript of Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sec22b, Length 2,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Slc35f3Q1LZI2 421 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dhrs11Q3U0B3 260 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mtmr11Q3V1L6 700 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 JamlQ80UL9 379 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam212bQ80VY2 300 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 C8bQ8BH35 589 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Foxj3Q8BUR3 623 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fgd2Q8BY35 655 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rft1Q8C3B8 541 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm9938Q8C3P5 112 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 4930447A16RikQ9D5F6 132 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cir1Q9DA19 450 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr971Q9EQ96 307 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1109A2AT96 312 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1206A2ATJ9 307 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam84bD3YXJ5 310 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Susd1E9Q3H4 752 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Bnip2O54940 326 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Agtr1aP29754 359 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rab33aP97950 237 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Xrcc1Q60596 631 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ift52Q62559 426 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1065Q7TR70 313 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr517Q7TRU4 314 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tmem106cQ80VP8 260 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Slc30a6Q8BJM5 460 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Nyap2Q8BM65 682 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Q8C5S3 137 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Saysd1Q8K190 188 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 SdhaQ8K2B3 664 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 HpgdQ8VCC1 269 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ocel1Q8VCR9 219 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 SgtbQ8VD33 304 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Klhdc8aQ91XA8 350 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr459Q924H8 314 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mrps16Q9CPX7 135 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Obp1aQ9D3H2 163 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pycr3Q9DCC4 274 aa10.6□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1193A2AV13 318 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm8374L7N2A9 172 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 IghgP01863 330 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 RhoP15409 348 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tas2r123P59528 333 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ppp2cbP62715 309 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ppp2caP63330 309 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Masp1P98064 704 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Epha4Q03137 986 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Nr0b1Q61066 472 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Znf728Q6P5C7 752 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rpl35Q6ZWV7 123 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Eci3Q78JN3 317 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pttg1ipQ8R143 174 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cd207Q8VBX4 331 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1312Q8VF10 317 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr993Q8VF75 314 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 St3gal6Q8VIB3 329 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mrgpra4Q91WW2 313 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mrgpra3Q91WW3 302 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ccdc167Q9D162 97 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tmem35aQ9D328 167 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CalyQ9DCA7 226 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PbkQ9JJ78 330 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr545Q9WU94 316 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm11758A2BEI6 360 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm11757A2BEI8 360 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Serpina3jD3Z451 420 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r169L7N275 304 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cx3cl1O35188 395 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ppt2O35448 302 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tcrg-V1P06325 135 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PpibP24369 216 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Adh5P28474 374 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 TaglnP37804 201 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Hsd11b1P50172 292 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 SctQ08535 133 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Agbl4Q09LZ8 540 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Riiad1Q3KNY5 119 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 1700066B19RikQ3TS39 127 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ptpn21Q62136 1176 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cyb561a3Q6P1H1 242 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr1349Q7TQV1 317 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr855Q7TRF8 312 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Clec4a1Q80UI7 245 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tmem222Q8BVA2 208 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Aqp3Q8R2N1 292 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sytl3Q99N48 607 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fdx2Q9CPW2 174 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Frem3Q5H8B9 2123 aa10.59□□□□□ -0.71
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr115B2RTB9 312 aa10.58□□□□□ -0.72
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pbx2O35984 430 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms