RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619710.4

PARVB-210, Transcript of parvin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARVB, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVB-210ENST00000619710 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 TRILQ7L0X0 811 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PXKQ7Z7A4 578 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 CDC20BQ86Y33 519 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 TMEM156Q8N614 296 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ESX1Q8N693 406 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 SYT14Q8NB59 555 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 CT55Q8WUE5 264 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 TSSK2Q96PF2 358 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 INTS14Q96SY0 518 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 EDEM2Q9BV94 578 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 GPR87Q9BY21 358 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 SYT4Q9H2B2 425 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 COPS3Q9UNS2 423 aa14.66□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 LRRTM2O43300 516 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 SEC14L5O43304 696 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 SC5DO75845 299 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ARL6IP5O75915 188 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 TLE3Q04726 772 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 CHAF1BQ13112 559 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 OXA1LQ15070 435 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 HPF1Q9NWY4 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 B9D1Q9UPM9 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PARVB-210ENST00000619710 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 B4DXG7 233 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 C21orf140B9A014 251 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 MS4A18H0YCH9 400 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 KRT8P05787 483 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 EDNRAP25101 427 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 DEFA1P59665 94 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 DEFA3P59666 94 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 IFITM3Q01628 133 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 SELENBP1Q13228 472 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 ATP1A4Q13733 1029 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 POC1BQ8TC44 478 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 NTNG2Q96CW9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 ARL5BQ96KC2 179 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 MFRPQ9BY79 579 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.64□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 A0A1W2PNV4 684 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 H7C1C5 153 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 DCTN6O00399 190 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 PFDN1O60925 122 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 CELA2AP08217 269 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 ALOX5APP20292 161 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 42.9
PARVB-210ENST00000619710 OTX2P32243 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 LCN6P62502 163 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 C5orf34Q96MH7 638 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 ABCB9Q9NP78 766 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 LAMA1P25391 3075 aa14.63□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.62□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 C4orf47A7E2U8 309 aa14.62□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 C9orf172C9J069 976 aa14.62□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 SNPHO15079 494 aa14.62□□□□□ -0.07
PARVB-210ENST00000619710 TBX1O43435 398 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms