RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577241.1

MSI2-205, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-205	ENST00000577241	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A0A1W2PR80	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CENPBD1	B2RD01	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		M0R1B8	84 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		M0R3G1	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IFI30	P13284	250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CAMK2D	Q13557	499 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TAF11	Q15544	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF566	Q969W8	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PYURF	Q96I23	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		J3KTA2	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FFAR1	O14842	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PRSS23	O95084	383 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IGHG1	P01857	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NR2C1	P13056	603 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SLC9A3	P48764	834 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CDH11	P55287	796 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SMIM11A	P58511	58 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PRKCD	Q05655	676 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DGCR6	Q14129	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A0A087WUU8	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A0A096LPE4	126 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ARPC2	O15144	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MGRN1	O60291	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	AQP2	P41181	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	OAF	Q86UD1	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	CRYAA	P02489	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	F13B	P05160	661 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	DANCR	P0C864	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MSI2-205	ENST00000577241	PAX1	P15863	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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