RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		A6NIZ1	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909		H7C0C1	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR1F1	O43749	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GMDS	O60547	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCN2B	O60939	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT2B4	P06133	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MELTF	P08582	738 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCNB1	P14635	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SDC1	P18827	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD80	P33681	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINB5	P36952	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TALDO1	P37837	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OMP	P47874	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RGS4	P49798	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB9A	P51151	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NUP107	P57740	925 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2B6	P58173	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB11A	P62491	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NTHL1	P78549	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RCAN2	Q14206	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FCN2	Q15485	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB11B	Q15907	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PARG	Q86W56	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	RILP	Q96NA2	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF302	Q9NR11	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MET	P08581	1390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TM7SF2	O76062	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	REN	P00797	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHG3	P01860	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINB2	P05120	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMC3	P17980	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	G0S2	P27469	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTB	P60709	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXCR4	P61073	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTA2	P62736	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTG1	P63261	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTG2	P63267	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTC1	P68032	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTA1	P68133	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LTB4R	Q15722	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	VAMP3	Q15836	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	GUK1	Q16774	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	MICA	Q29983	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TOM1L1-222	ENST00000575909	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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