RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF223E7ERA6 249 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CXCR6O00574 342 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIP5K1CO60331 668 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 DSCAMO60469 2012 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF682O95780 498 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HLA-HP01893 362 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRYAAP02489 173 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MT-ND1P03886 318 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASAH2BP0C7U1 165 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD79AP11912 226 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 B4GALT1P15291 398 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 FUT1P19526 365 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CALCRP30988 508 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SELENOWP63302 87 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIGFQ07326 219 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF544Q6NX49 715 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM239Q8WW34 195 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXO17Q96EF6 278 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SGTBQ96EQ0 304 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR7A10O76100 309 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 F13BP05160 661 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HEXAP06865 529 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CBR1P16152 277 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NCK1P16333 377 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 DRD4P21917 467 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 FUT4P22083 530 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 LSP1P33241 339 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSK3BP49841 420 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUDT6P53370 316 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZP4Q12836 540 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR6X1Q8NH79 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 LZICQ8WZA0 190 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRR1Q96L50 414 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOX3Q9HBY0 568 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED31Q9Y3C7 131 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 J3KTA2 159 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERPINA1P01009 418 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGKV3-15P01624 115 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGLV1-44P01699 117 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 AQP2P41181 271 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSME3P61289 254 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNGT1P63211 74 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAB35Q15286 201 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ETFDHQ16134 617 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM54Q969K7 222 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF566Q969W8 418 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM162AQ96A26 154 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 POM121Q96HA1 1249 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRRC1Q96M27 445 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXB1Q99853 325 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CA10Q9NS85 328 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLTPQ9NZD2 209 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITPR3Q14573 2671 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GMNCA6NCL1 334 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCIDASD6RGH6 385 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNX3O60493 162 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL10O95999 233 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNW1P05000 195 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARR3P36575 388 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHRNB3Q05901 458 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 RUNX1T1Q06455 604 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ST3GAL3Q11203 375 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MST1LQ2TV78 715 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 REG4Q9BYZ8 158 aa15.44■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PRG6 482 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 LY6HO94772 140 aa15.43■□□□□ 0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR4A8P0C604 315 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms