RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 CACNG2Q9Y698 323 aa13.77□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 ANP32DO95626 131 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 BCL10O95999 233 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 HTR2AP28223 471 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 DEFA6Q01524 100 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 GLO1Q04760 184 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 C1QL2Q7Z5L3 287 aa13.76□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 MAL2Q969L2 176 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 VPS33AQ96AX1 596 aa13.76□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.76□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 TPT1P8Q9HAU6 139 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 CALML5Q9NZT1 146 aa13.76□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 LIMS1P48059 325 aa13.75□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 TSTQ16762 297 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.75□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 SLC38A4Q969I6 547 aa13.75□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 FOXB1Q99853 325 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.75□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 ZNF726A6NNF4 738 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 AHCYP23526 432 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 REP15Q6BDI9 236 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 SH3GL3Q99963 347 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.74□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 A0A0X1KG70 313 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 C17orf100A8MU93 164 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 C11orf98E9PRG8 122 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 OR2T1O43869 369 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 LCKP06239 509 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 ARAFP10398 606 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 KITP10721 976 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 ANPEPP15144 967 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 RAD52P43351 418 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 LCN2P80188 198 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 PMS2P3Q13401 168 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 PRR31Q5SQ13 230 aa13.73□□□□□ -0.21
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CS-227ENST00000551441 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 C7orf69Q9H7B7 122 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 SLC7A8Q9UHI5 535 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 IFT52Q9Y366 437 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 TMEM247A6NEH6 219 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-227ENST00000551441 TPST1O60507 370 aa13.72□□□□□ -0.21
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