RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 F10P00742 488 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PRH1P02810 166 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SSTR2P30874 369 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TGM4P49221 684 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 HSF1Q00613 529 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RDH10Q8IZV5 341 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TSLPQ969D9 159 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TSSK2Q96PF2 358 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 OR52D1Q9H346 318 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GWA3 101 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A12P48065 614 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 OR52W1Q6IF63 320 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LANCL2Q9NS86 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 FABP12A6NFH5 140 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM233B4DJY2 109 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LY86O95711 162 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 IL1AP01583 271 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV3-19P01714 112 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 FOLR1P15328 257 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF17P17021 662 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PTAFRP25105 342 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEA3P43357 314 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 THBS3P49746 956 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 KNTC1P50748 2209 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-25P63136 954 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 UGT8Q16880 541 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PGGHGQ32M88 737 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM205Q6UW68 189 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SBSNQ6UWP8 590 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TPK1Q9H3S4 243 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 WDR76Q9H967 626 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ITM2AO43736 263 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A5O76082 557 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R46P59540 309 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GSG1Q2KHT4 349 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LCN8Q6JVE9 175 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CD163Q86VB7 1156 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 HES4Q9HCC6 221 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RAB18Q9NP72 206 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PRR19A6NJB7 356 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PATE3B3GLJ2 98 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 IMPA2O14732 288 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SULT1C4O75897 302 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 DBHP09172 617 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 MEF2DQ14814 521 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PPA1Q15181 289 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 C4orf46Q504U0 113 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 RASD2Q96D21 266 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GUCD1Q96NT3 240 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CDHR4A6H8M9 788 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 NUDT19A8MXV4 375 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CLDN25C9JDP6 229 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF4O60810 478 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF21O75509 655 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 SOX14O95416 240 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 351.6 ms